第二季承接首季结尾，亚契船长带领进取号驶入更未知的星域。本季核心聚焦于一个极具讽刺意味的外星种族——利尔人。他们抛弃了情感，建立了纯粹的逻辑社会，却因此丧失了繁衍的欲望和面对突发危机的应变能力，正走向自我毁灭。特珀被迫面对自己瓦肯人的情感压抑，而佐藤星则需要用语言学破解一个正在吞噬星球的“逻辑病毒”。与此同时，克林贡帝国的威胁持续升级，一艘神秘的罗慕兰战鸟在暗处监视着进取号的一举一动。亚契不得不在最高指导原则尚未建立的情况下，做出是否干预利尔人生死的艰难决定。这一季提出了一个尖锐的问题：没有温度的理性，真的是文明进化的终点吗？
第二季比第一季更黑暗也更深刻，完美承接了《星际迷航》一贯的人文关怀。利尔人的设定简直就是现代社会某些极端现象的投射，看得人脊背发凉。马球场的动作戏设计很有新意，特珀的角色弧光非常动人，结尾那场关于“孤独”的独白值得一座艾美奖。
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